Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms