Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARXQ96QS3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms