Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLMNQ96JQ2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms