Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.5 ms