Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
STAMBPL1Q96FJ0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms