Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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