Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC1Q96C34 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms