Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms