Protein–RNA interactions for Protein: Q969S0

SLC35B4, UDP-xylose and UDP-N-acetylglucosamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35B4Q969S0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35B4Q969S0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms