Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEO1Q92859 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEO1Q92859 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms