Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms