Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC12Q8WUD4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms