Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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BEST4Q8NFU0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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BEST4Q8NFU0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST4Q8NFU0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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