Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC17Q8N6Y2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms