Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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C9orf40Q8IXQ3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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C9orf40Q8IXQ3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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C9orf40Q8IXQ3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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C9orf40Q8IXQ3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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C9orf40Q8IXQ3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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C9orf40Q8IXQ3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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C9orf40Q8IXQ3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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C9orf40Q8IXQ3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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C9orf40Q8IXQ3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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