Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF2Q8IX21 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLF2Q8IX21 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLF2Q8IX21 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms