Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms