Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV5

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q86YV5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAG1Q86YV5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms