Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TRAPPC6BQ86SZ2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TRAPPC6BQ86SZ2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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TRAPPC6BQ86SZ2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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TRAPPC6BQ86SZ2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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TRAPPC6BQ86SZ2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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TRAPPC6BQ86SZ2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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