Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms