Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms