Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUSD1Q6UWL2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms