Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC9A4Q6AI14 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms