Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms