Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUPD1Q68J44 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUPD1Q68J44 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms