Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG9BQ674R7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG9BQ674R7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms