Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q5VSD8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Q5VSD8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms