Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms