Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC31

CCDC58, Coiled-coil domain-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC58Q4VC31 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC58Q4VC31 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms