Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF1Q3BBV0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms