Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TWISTNBQ3B726 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWISTNBQ3B726 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms