Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Q1T7F1 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Q1T7F1 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
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