Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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