Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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