Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
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GABRA6Q16445 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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GABRA6Q16445 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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GABRA6Q16445 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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GABRA6Q16445 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA6Q16445 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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GABRA6Q16445 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA6Q16445 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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GABRA6Q16445 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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GABRA6Q16445 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GABRA6Q16445 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA6Q16445 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA6Q16445 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GABRA6Q16445 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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GABRA6Q16445 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
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