Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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