Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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