Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms