Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A3Q14050 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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