Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2H3Q13889 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms