Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms