Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALCAMQ13740 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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