Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PMS2P11Q13670 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms