Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4BQ13620 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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