Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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