Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEX6Q13608 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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