Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EIF4EBP1Q13541 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms