Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCIRG1Q13488 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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