Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRSQ13332 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms