Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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